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AAV代碼
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腺相關病毒代碼
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疾病研究(心、肝、肺)

疾病研究(心、肝、肺)

  基於對病毒載體的深入了解和研發,越來越多的科研人員開始藉助病毒載體進行疾病研究。目前,病毒載體工具在不同組織器官中均有大量的應用,通過使用工具病毒載體,對疾病相關基因進行定向和組織特異性的改造和操控,已成為科研人員進行疾病研究與治療的一種技術手段。

  病毒載體的選擇
  
  不同病毒載體的大小迥異,意味着其內含基因容量存在巨大差異;免疫原性的不同,意味着其體內/體外應用的場景需要細微調整;表達時間和周期的不同,意味着我們需要根據研究需求進行相對應的選擇。

表1 不同病毒的生物學特性比較
  慢病毒 腺相關病毒 腺病毒 逆轉錄病毒
包膜
顆粒直徑 80-100 nm 20-30 nm 90-100nm ~100nm
基因組 dsRNA ssDNA dsDNA RNA
基因組大小 9.75kb 4.7kb 36kb ~5kb
表達起始時間 48-72h 72-96h 24-48h 48-72h
表達持續時間 > 2 months > 6 months < 1 month > 2 months
體內擴散能力 一般 一般
免疫原性 中等 極低 中等
滴度範圍 108~109TU/mL 1012-1013VG/mL 1011-1012PFU/mL 107~108TU/mL
滴度檢測方法 qPCR整合DNA qPCR非整合DNA 抗原抗體免疫染色試劑盒 qPCR整合DNA
整合方式 隨機高頻整合 定向低頻整合(rAAV不整合) 非整合 隨機整合
應用範圍 體外細胞感染,gRNA文庫篩選,體內 基於不同的血清型,體內廣泛應用 嗜肝,快速表達或短期表達,血液、心臟,細胞系等  特異性只感染分裂期的細胞
  重組腺相關病毒載體(rAAV),一直是體內研究的明星載體,除了其免疫原性極低、安全性高、宿主細胞範圍廣、擴散能力強、體內表達基因時間長等優勢外,還在於其種類多樣性。
  
  現在研究中常用的rAAV就是利用AAV2型基因組與不同的衣殼蛋白結合產生的混合體病毒載體,一般標記為rAAV2/N (N為不同的衣殼血清型)。重組的病毒具有AAV2型的穩定表達和基因整合能力,同時獲得了不同血清型的組織感染嗜親性,表現出一定的器官靶向特異性。
表2 不同血清型AAV的組織嗜親性
血清型 組織親和性
rAAV2/1 神經系統(高滴度順向跨突觸),肌肉,骨骼肌,心肌,平滑肌
rAAV2/2 神經系統,肌肉,肝臟,血管平滑肌,眼
rAAV2/3 肌肉,肝臟,肺,眼
rAAV2/4 神經系統,肌肉,眼,腦
rAAV2/5 神經系統,肺,視網膜,肝臟,滑膜關節
rAAV2/6 神經系統,肺,肌肉,心臟
rAAV2/7 肌肉,肝臟
rAAV2/8 神經系統,肝臟,胰腺,視網膜,脂肪組織
rAAV2/9 神經系統,心肌,肺,視網膜,皮膚,肌肉,脂肪組織
rAAV2-retro 神經系統(逆向非跨突觸)
AAV-PHP.eB 跨血腦屏障(靜脈注射)
AAV-PHP.S 全外周神經(尾靜脈注射)
AAV-PAN 胰腺(腹腔注射)
AAV-LUNG 肺(尾靜脈注射)
AAV-DJ 視網膜,肺,腎臟,體外感染細胞
AAV-7m8 視網膜
AAV-ShH10Y 視網膜Muller細胞
AAV-Rh10 肝臟,血液,心臟,體外感染細胞
AAV-Anc80L65 內耳、視網膜、骨骼肌、肝臟
AAV-SCH9 SVZ區神經幹細胞
 
  小建議:如您不確定選擇哪種血清型,可嘗試使用尊龙凯时Pandora’s Virus (AAV試用裝)進行預實驗,通過比較不同血清型對目標組織的感染效果,摸索最佳實驗條件(注射方法、注射位點、病毒用量等),以便得到更理想的實驗結果。(連結到Pandora’s Virus>>)

肝臟

  肝臟是調控機體脂質代謝、血糖代謝的重要器官,其功能異常會導致脂肪肝、高膽固醇血症、高血脂症、糖尿病等疾病。
  
  1、注射方式
  
  應用病毒載體感染肝臟一般採用尾靜脈注射的方式。
  
  按照尊龙凯时多年的經驗,使用AAV載體感染肝臟組織一般選取AAV2/8血清型,通過尾靜脈注射手段感染肝臟每隻小鼠需要注射1x1010總滴度的病毒載體。
 
  
  尊龙凯时AAV感染結果
  
  2、應用案例
  
  2.1 肝臟特異啟動子TGB
  
  客戶發表文章:FASEB Journal. (IF=5.391). Yang Y,et.al. (2018). Long-term exercise prevents hepatic steatosis: a novel role of FABP1 in regulation of autophagy-lysosomal machinery. [非酒精性脂肪肝,自噬溶酶體,腺相關病毒過表達]
`
  
  注射方式:小鼠尾靜脈注射
  
  載體:AAV8-TGB-Fabp1
  
  血清型:rAAV2/8
  
  注射量:200ul,2× 1011 VG
  
  觀察時間:1周
  
  2.2 Cre-loxp技術在小鼠肝臟中的應用
  
  由於腺病毒高度嗜肝,幾乎90%以上會感染肝臟,因此腺病毒可以作為肝臟特異性感染的有效載體。將Cre腺病毒(Ad-Cre)通過尾靜脈注射入帶有loxp小鼠體內,即可實現肝臟特異性表達並將目的基因敲除,從而快速獲取肝臟特異性基因敲除小鼠。
  
  2.3 CRISPR/Cas9技術在小鼠肝臟中的應用
  
  通過腺病毒將CRISPR/Cas9系統相關元件(Cas9和sgRNA)注射入小鼠體內,可以實現在肝臟中特異性表達,並實現肝臟部位的特異性敲除。此方法比較適合檢驗活體實驗。

胰腺

  胰腺是一個兼有內、外分泌功能的器官,與機體消化、血糖代謝、脂質代謝等有密切的關係,也是代謝研究的關鍵目標器官之一。
  
  在實際研究中,使用病毒載體感染胰腺主要有兩種方式,一種是使用AAV2/8病毒載體,通過膽管將病毒注射入胰腺;另一種新方法是使用尊龙凯时新研發的AAV-PAN病毒載體,腹腔注射感染胰腺:
尊龙凯时AAV-PAN感染結果

心臟

  1、注射方式
  
  AAV的注射方式,不同的文章中採用了不一樣的注射方式。總體上,一般包括靜脈注射、心腔內注射、心肌內定點注射、心包內注射(介於心肌與心包膜之間),其中靜脈注射包括尾靜脈注射、頸靜脈注射、面部靜脈注射等。
  
  尾靜脈注射和心腔內注射由於病毒流進血液循環,分佈較均勻。心腔內注射需要結合主動脈嵌夾進行,由於開胸腔手術需要輔助呼吸,對手術操作要求較高。心肌內定點注射時每點注射2-5ul,效果是在注射的局部點附近表達較高,但擴散非常有限。總的來說,很多實驗直接用尾靜脈注射即可,但是可能需要較高劑量的病毒,如果用心肌內定點注射,即小量多點注射,可以達到很好的感染表達效果,但是後者操作技術難度略高,也需要花費更長的操作時間。
  
  結合新生鼠(出生2-10天)注射效果比較來看,新生鼠注射表達效果大大優於成年鼠,消耗病毒劑量也相對較低。新生鼠的注射,一般根據實驗室的條件來看,可以選擇頸靜脈注射、面部靜脈注射和心腔內(左心室)注射,目的是將病毒導入血液循環中。
  
  2、啟動子選擇
  
  一些常用啟動子如CMV、CAG、αMHC、cTnC等常被用於驅動在心臟組織中的表達。很多高效的啟動子由於片段較大,如αMHC,僅用於轉基因小鼠等實驗,不適合裝載在AAV載體上。通過查閱文獻,我們發現一些小的啟動子如CMV在心臟組織的表達能力比較強,特別對於大片段的驅動效果很明顯,但是如果需要介導的目的基因在心臟中特異性表達,則推薦使用cTnT啟動子,cTnT常被用於心肌的特異性表達,表達能力也很強。
  
  3、應用案例
  
  3.1 心臟特異性啟動子cTNT
  
  客戶發表文章:Yue Z, et al., (2019) PDGFR-b Signaling Regulates Cardiomyocyte Proliferation and Myocardial Regeneration. Cell Rep.
  
  注射方式:
  
  載體:AAV9
  
  血清型:rAAV2/9
  
  啟動子:cTnT
  
  注射量:200ul,2× 1011 VG
  
  觀察時間:1周
  
  3.2 Cas9心臟特異性轉基因小鼠
  
  科學家構建了帶有eSpCas9(1.1)的心臟特異性轉基因小鼠,通過Myh6基因的啟動子(αMHC)驅動Cas9在心肌的特異性表達。αMHC啟動子是心臟特異性轉基因小鼠常用啟動子。這個工具小鼠能夠解決實驗過程中Cas9在心臟遞送和表達的難題。轉基因小鼠可以維持Cas9在心臟長期高水平的表達,而這個正是CRISPR/Cas9系統在心臟部位編輯效率不高的癥結所在。
  
  Cas9轉基因小鼠,只需要通過AAV遞送sgRNA到心臟表達即可實現,這種方法可以獲得比較高的編輯效率。研究人員將靶向Myh6基因外顯子sgRNA通過裝載在AAV載體上注射入小鼠,實現心臟特異性敲除。Myh6表達水平降低50%以上,同時成功得到發生心肌肥厚和擴張型心臟的突變小鼠。

肺部

  目前對於肺部的病毒感染,普遍採用AAV病毒載體,使用病毒載體感染胰腺主要有兩種方式,一種是使用AAV2/9病毒載體,通過鼻內或氣管內遞送(經呼吸道)將病毒通過肺呼吸道遞送,參考劑量是1×1011VG病毒,體積50ul;另一種新方法是使用尊龙凯时新研發的AAV-LUNG病毒載體,尾靜脈注射特異性感染肺部:
  

  尊龙凯时AAV-LUNG感染肺部結果

肌肉

  目前,對於肌肉組織中使用的病毒載體通常會選用AAV病毒載體,因為AAV不僅能夠高效特異地靶向肌肉組織,且能在肌肉組織中表達持久。腺病毒使用時容易引起較強的免疫反應,並且很容易被清除,表達時間比較短暫,較少被應用於肌肉組織的靶向表達。儘管慢病毒感染表達範圍廣泛,對培養的肌肉細胞均能高效表達,但是對肌肉組織的感染表達非常有限。目前靶向肌肉的AAV載體血清型主要為AAV1,AAV6和AAV9。其中,AAV9的表達效率最高,並且更容易在肌肉中高表達。
  
  1、注射方式
  
  應用病毒載體感染肌肉組織進行研究,一般分為系統注射和肌肉內注射,系統注射表達較均勻,但是大部分病毒會被其他臟器組織吸收,導致靶向肌肉的病毒較少。肌肉內注射是一種定點注射,可以在注射點附近高效表達,但缺點是病毒擴散十分有限,因此往往需要多點注射,一般每個點在5-10ul。
  
  2、應用案例
  
  注射方式:靜脈注射
  
  載體:AAV-CMV-miniDystrophin
  
  血清型:rAAV2/9
  
  觀察時間:16周

脂肪組織

  脂肪組織由大量脂肪細胞組成,分為白色脂肪、棕色脂肪和米色脂肪組織,脂肪組織是機體冗餘能量儲存的重要器官,同時也是重要的分泌器官,在機體的血糖代謝、脂質代謝、慢性炎症、傷疤修復等中有重要的生理功能。
  
  研究中,如果我們使用病毒載體感染脂肪組織,一般採用定點注射的方式。使用AAV病毒載體感染脂肪組織一般選取rAAV2/8血清型,在脂肪組織的多點注射中,每個點注射量大約1x1010總滴度的病毒載體。

  AAV感染脂肪

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