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      AAV代碼
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      腺相關病毒代碼
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      腺相關病毒AAV

      腺相關病毒AAV

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      腺相關病毒(adeno-associated virus, AAV)是微小病毒科(parvoviridae)家族的成員之一,是一類無法自主複製、無被膜的二十面體微小病毒,其直徑約20-26nm,含有4.7kb左右的線狀單鏈DNA作為基因組。研究中採用的重組腺相關病毒載體(recombination adeno-associated virus, rAAV)是在非致病的野生型AAV基礎上改造而成的基因載體,由於其種類多樣、免疫原性極低、安全性高、宿主細胞範圍廣(對分裂細胞和非分裂細胞均具有感染能力)、擴散能力強、體內表達基因時間長等,rAAV被視為最有前途的基因研究和基因治療載體之一。

      AAV基因組結構

       

       rAAV包裝純化及滴度檢測
            AAV包裝過程中,包裝質粒負責編碼目的基因以及兩個末端反向重複序列(ITR,對於病毒的複製和包裝具有決定性作用),輔助質粒包含AAV包裝所需的cap(編碼病毒衣殼蛋白)和rep(參與病毒的複製)基因,以及腺病毒Helper質粒。三種質粒共同轉染293T細胞後,AAV病毒開始複製和包裝。尊龙凯时腺相關病毒的生產和質控採取了國際學術界公認的標準流程,採用三質粒系統在293T細胞中進行包裝。所獲得的病毒顆粒經過超速離心純化,並通過qPCR對病毒基因拷貝進行滴定。另外,我們也可以根據使用者要求,提供蛋白染色檢測衣殼蛋白的完整性以及內毒素含量等。一般情況下rAAV的滴度在1012~1013 VG/ml,完全可以滿足各類整體實驗的使用要求。
      AAV包裝流程圖

      滴度檢測方法:定量PCR檢測病毒基因組中外源DNA拷貝數。
      滴度檢測原理:腺相關病毒的基因組為單鏈DNA,外源DNA拷貝數代表病毒基因組拷貝數。

       rAAV侵染細胞過程
          純化後的AAV病毒載體可以用於侵染細胞,侵染細胞時,AAV與細胞表面特異性受體結合,激活胞內信號通路,進而觸發AAV通過受體介導的內吞作用進入細胞,在核內體、高爾基體等細胞器的協助下進入細胞核,隨後病毒裂解,其單鏈DNA需複製成為雙鏈DNA後表達目的基因。

      rAAV作用機制

       rAAV載體優勢
      1、安全性高、免疫原性低:AAV是一種複製缺陷型DNA病毒,無自主複製能力,野生型AAV依賴rep基因進行低頻定點整合,rAAV不整合。目前尚無由AAV引起的人類及哺乳動物疾病報道,也是FDA批准上市的基因治療藥物中最安全的病毒載體之一。
      2、宿主細胞範圍廣:AAV具有廣泛的宿主範圍,對分裂細胞和非分裂細胞均具有感染能力。
      3、擴散能力強:AAV直徑約20-26nm,體積小,滴度高,具有良好的擴散能力,其中AAV-PHP.eB和AAV9具有跨血腦屏障的能力,在神經科學領域應用廣泛。
      4、體內表達基因時間長:AAV具有保持長期基因轉錄表達能力,體內表達一般3周可以達到高峰,隨後持續高表達,作用時間>5個月。
      5、種類多樣:AAV血清型眾多,此外,根據不同的實驗設計,我們還在不斷的突變,篩選新的血清型(AAV1-13,AAV2/1, 2/2, 2/5, 2/6, 2/8, 2/9, DJ; retro, PHP.eB…)。

      不同病毒的生物學特性比較
          基於上述特點,AAV被視為是一種高效和安全的體外及體內基因轉導工具。尤其在整體水平研究中,與其他常用病毒工具載體相比,AAV具有感染過程溫和長效的表達能力,是基因操作的利器。

       rAAV血清型選擇
            目前已註冊的AAV種類總數已超過196種,靈長類動物體內有13種不同血清型的AAV(即AAV1-AAV13),其中AAV2、AAV3、AAV9源自人類本身,值得注意的是,AAV2是最早被克隆的病毒,也是迄今研究最為徹底、應用最為廣泛的病毒載體。隨着研究的不斷深入,研究人員發現不同血清型的AAV之間可以雜交,而雜交後的AAV會兼有雜合雙方的特點,因此,AAV亞型順勢誕生。
           現在研究中常用的rAAV就是利用AAV2型基因組與不同的衣殼蛋白結合產生的混合體病毒載體,一般標記為rAAV2/N (N為不同的衣殼血清型)。重組的病毒具有AAV2型的穩定表達和基因整合能力,同時獲得了不同血清型的組織感染嗜親性(不同血清型衣殼表面的特定結構位點決定了各自受體的特異性),表現出一定的器官靶向特異性。
      不同血清型AAV的組織嗜親性
      血清型 組織親和性
      rAAV2/1 神經系統(高滴度順向跨突觸),肌肉,骨骼肌,心肌,平滑肌
      rAAV2/2 視網膜、神經系統,肌肉,肝臟,血管平滑肌
      rAAV2/3 肌肉,肝臟,肺,眼
      rAAV2/4 神經系統,肌肉,眼,腦
      rAAV2/5 神經系統,肺,視網膜,肝臟,滑膜關節
      rAAV2/6 神經系統,肺,肌肉,心臟
      rAAV2/7 肌肉,肝臟
      rAAV2/8 神經系統,肝臟,肌肉,脂肪組織,胰腺,視網膜,
      rAAV2/9 神經系統,心肌,肺,視網膜,皮膚
      rAAV2-retro 神經系統(逆向非跨突觸)
      AAV-PHP.eB 跨血腦屏障(靜脈注射)
      AAV-PHP.S 全外周神經(尾靜脈注射)
      AAV-PAN 胰腺(腹腔注射)
      AAV-LUNG 肺(尾靜脈注射)
      AAV-DJ 視網膜,肺,腎臟,體外感染細胞
      AAV-7m8 視網膜
      AAV-ShH10Y 視網膜Muller細胞
      AAV-Rh10 肝臟,血液,心臟,體外感染細胞
      AAV-Anc80L65 內耳、視網膜、骨骼肌、肝臟
      AAV-SCH9 SVZ區神經幹細胞

            小建議:如您不確定選擇哪種血清型,可嘗試使用尊龙凯时Pandora’s Virus (AAV多種血清型)進行預實驗,通過比較不同血清型對目標組織的感染效果,摸索最佳實驗條件(注射方法、注射位點、病毒用量等),以便得到更理想的實驗結果。
            Pandora’s Virus 詳情:

       

       rAAV載體應用案例
      1、在神經科學領域中的應用
      1.1 外側韁核&光遺傳學
      客戶發表文章:Nature. (IF=41.577). Yang Y,et.al. (2018). Ketamine blocks bursting in the lateral habenula to rapidly relieve depression. [腺相關病毒, 抑鬱症, 光遺傳]
       

      注射部位:小鼠LHb
      載體:AAV2/9-hSyn-oChIEF-tdTomato
      血清型:AAV2/9
      病毒滴度:6.29E+12 VG/mL
      注射體積:100nl
      觀察時間:1個月

      1.2 臂旁核&化學遺傳學
      客戶發表文章:Science. (IF=41.058). Mu D,et.al. (2017). A central neural circuit for itch sensation. [腺相關病毒, 癢, 光遺傳,化學遺傳]

      注射部位:小鼠PBN
      載體:AAV-hSyn-HA-hM4Di-IRES-mCitrine
      血清型:AAV2/9
      病毒滴度:1E+13 VG/mL
      注射體積:150nl
      觀察時間:3周

      1.3 丘腦&鈣離子成像
      客戶發表文章:客戶發表文章:Science. (IF=41.058). Ren S,et.al. (2018). The paraventricular thalamus is a critical thalamic area for wakefulness. [腺相關病毒, 覺醒]

      注射部位:小鼠PVT
      載體:AAV-CaMKIIα-GCaMP6f
      注射體積:100nl
      觀察時間:4周

      1.4 丘腦室旁核&殺死神經元
      客戶發表文章:Science. (IF=41.058). Ren S,et.al. (2018). The paraventricular thalamus is a critical thalamic area for wakefulness. [腺相關病毒, 覺醒]

      注射部位:小鼠PVT
      載體:AAV-CaMKIIα-Cre-GFP &AAV-DIO-caspase-3
      注射體積:兩支病毒1:1混合注射100nl
      觀察時間:4周

      1.5 海馬、皮層&逆向非跨突觸(rAAV2/retro)
      客戶發表文章:Biological Psychiatry. (IF=11.984). Bing Xing Pan,et.al. (2018). Chronic stress causes projection-specific adaptation of amygdala neurons via SK channel downregulation. [腺相關病毒, 焦慮症, 光遺傳]


      注射部位:小鼠dmPFC、VHPC
      載體:AAV2/1-retro-Syn-eYFP-Cre、AAV2/8-CaMKIIα-DO-SK2&AAV2/8-CaMKIIα-DIO-SK2-mCherry
      注射體積:300nl
      觀察時間:4周

      1.6 初級運動皮層&順向跨突觸(rAAV2/1)
      Nature Neuroscience. (IF=19.912). Yao J,et.al. (2018). A corticopontine circuit for initiation of urination. [腺相關病毒, 神經環路]

      注射部位:小鼠皮層M1、PMC
      載體:rAAV2/1-hSyn-Cre&rAAV2/9-DIO-hChR2(H134R)-mCherry、rAAV2/9-DIO-GCaMP6s
      病毒滴度:rAAV2/1: 5E+12 VG/mL;rAAV2/9-DIO-hChR2:1.2E+13 VG/mL;rAAV2/9-DIO-GCaMP6s:1E+12 VG/mL
      注射體積:多點注射,每位點30-40nl
      觀察時間:4周

      1.7 邊緣前皮質&跨突觸示蹤(WGA-Cre)
      客戶發表文章:Science Advances. (IF=11.511). Ping Zheng,et.al. (2019). Crucial role of feedback signals from prelimbic cortex to basolateral amygdala in the retrieval of morphine withdrawal memory. [腺相關病毒, 成癮, AAV1, AAV-WGA-Cre]

      注射部位:小鼠PrL
      載體:AAV-hSyn-mCherry-IRES-WGA-Cre
      病毒滴度:4.28E+12 VG/mL
      注射體積:300nl
      觀察時間:4周

      1.8 皮層&AAV干擾(AAV-shRNA)
      客戶發表文章:Nature Medicine. (IF=22.864). Cao X,et.al. (2013). Astrocyte-derived ATP modulates depressive-like behaviors.[腺相關病毒, 抑鬱症]


      注射部位:小鼠mPFC
      載體:AAV-CMV-P2rx2 shRNA-EGFP
      病毒滴度:3E+12 VG/mL
      注射體積:1.5ul
      觀察時間:2周

      1.9 全腦表達&跨血腦屏障(AAV-PHP.eB)
       

       
      尊龙凯时—rAAV-PHP.eB尾靜脈注射感染全腦實例
      病毒總量:1.5E+11VG
      注射體積:200ul
      病毒表達時間:四周

      1.10稀疏標記
      應用文獻:Luo WS, et al., (2016) Supernova: A Versatile Vector System for Single Cell Labeling and Gene Function Studies in vivo. Sci Rep.
      載體信息:pAAV-PTRE-tight-NLS-Cre(108-109VG/mL)、pAAV-EF1a-DIO(tTA-P2A-mScarlet)-WPRE(1012VG/mL)

      1.11在視網膜中的應用

      尊龙凯时—玻璃體腔注射
      病毒載體:AAV-syn-GcaMP6s

      2、在其他臟器中的應用
      2.1 rAAV感染肝臟

       
      尊龙凯时—rAAV2/8尾靜脈注射感染肝臟實例
      病毒總量:1E+11VG
      注射體積:200ul
      病毒表達時間:四周

      2.2 rAAV感染心臟

       
      尊龙凯时—rAAV2/9尾靜脈注射感染心臟實例
      病毒總量:2E+11VG
      注射體積:200ul
      病毒表達時間:四周

      2.3 rAAV感染肺部

       
      尊龙凯时—rAAV-Lung尾靜脈注射感染肺部實例
      病毒總量:5E+11VG
      注射體積:200ul
      病毒表達時間:二周

      客戶發表文章:Cell. (IF=36.216). Huijuan Wu,et.al. (2020). Progressive Pulmonary Fibrosis Is Caused by Elevated Mechanical Tension on Alveolar Stem Cells. [腺相關病毒, 干擾]


      注射方式:氣管注射
      感染部位:肺部
      載體:pAAV-Tgfb1 shRNA
      血清型:rAAV2/9
      病毒注射量:1E+11 VG(50ul)
      觀察時間:3周
       

      2.4 rAAV感染腎臟

       
      尊龙凯时—rAAV2/8尾靜脈注射感染腎臟實例
      病毒總量:2E+11VG
      注射體積:200ul
      病毒表達時間:四周

      2.5 rAAV感染脂肪組織

      尊龙凯时—rAAV2/8腹股溝脂肪多點注射感染脂肪實例
      病毒總量:4E+10VG/側
      病毒表達時間:四周

      2.6 rAAV感染肌肉組織

      尊龙凯时—rAAV2/8後腿肌肉多點注射感染肌肉實例
      病毒總量:4E+10/側
      病毒表達時間:四周

      2.7 rAAV感染胰腺
      尊龙凯时—rAAV-PAN腹腔注射胰腺實例
      病毒總量:4E+11VG
      表達檢測時間:4周

       


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